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质粒生物学 B.E.芬内尔

时间:2012-08-19 18:27来源:生物吧 作者:管理员 点击:
购买链接: http://www.biobars.cn/shop/goods.php?id=1654 书籍介绍: 质粒是染色体外可以进行自我复制的遗传元件,广泛存在于各类生物体的细胞中。质粒对于分子生物学的发展及生命现象的揭
书籍介绍:
质粒是染色体外可以进行自我复制的遗传元件,广泛存在于各类生物体的细胞中。质粒对于分子生物学的发展及生命现象的揭示发挥着不可替代的作用。  
本书是关于质粒的百科全书,内容涉及质粒的研究历史,质粒的复制、分配和转移,质粒的生态学和进化,质粒用作遗传工具等,还专门讨论了一些重要类型的质粒。体现了下列特色:  
对质粒复制、分配和转移的机制进行了细致入微的分析;  
详细描述了一些成为研究热点的特殊质粒系统的各种生物学问题;  
专论与人类健康密切相关的各类有毒力和抗生素抗性质粒的生物学问题;  
介绍了质粒作为遗传工具的一些最新应用。  
本书可以用作微生物学、分子生物学等专业的教材或教辅,也可供生物类专业的研究人员阅读参考。 

[前言]
质粒是染色体外可自我复制的遗传元件,在各类生物细胞中均有发现。它们的存在影响到作为宿主的生物体,而且这种影响往往非常显著。质粒对于分子生物学的发展和对基本生命现象的认识一直发挥着不可替代的作用。质粒具有诸多令人惊异的特征,例如质粒的大小、复制和传播的方式、宿主范围以及所携带基因的功能。它们拥有各种手段以确保自身可靠地复制、维持和转移;它们为宿主细胞赋予了各式各样的表型。对于人类来说,有些表型很成问题,譬如对抗生素的抗性基因和各种妨碍人类及动物健康的致病基因。而有些表型则是很有用的,例如固定氮元素的能力和一些在科学实验中能够加以利用的特征。我们之所以怀着极大兴趣探索质粒的生物学正是由于质粒在形式、功能和应用方面存在丰富多样的内涵。本书的第1章向读者呈献了Donald R.Helinski的历史性评论文章,其中回顾了发生在过去几十年中推动该领域发展的许多重要事件。其余各章则分为6篇,囊括了复制、遗传功能、特有的质粒系统、质粒进化等基本生物学问题以及质粒作为遗传学研究工具的应用情况。自然界中的质粒系统非常庞大,本书用近一半的篇幅对某些质粒系统详加描述。譬如,通过质粒分子生物学和基因组的研究,对许多影响人类健康和生物质量的致病质粒有了较为深入的了解。质粒不仅存在于原核生物,在真核生物中也有发现。在一些独特的微生物中,也往往栖居着性质独特的质粒,如在螺旋体(Borrelia)和古生物中的情况即是如此。质粒在分子生物学实验室中是必不可少的,我们总要针对不同目的不断地把质粒进行改造以作为克隆、表达和诱变的遗传工具。在自然环境下质粒也可作为生物传感器和生物修复系统的部件派上重要用场。我们希望本书对于微生物学教学和研究能有所裨益。本书可以用作研究人员、学生和教师的参考资料,包含了一些有关质粒生物学各个方面的基本信息。我们的目的是向读者奉上有关质粒研究的最新进展情况,包括质粒对细菌致病机理、进化、基因组分析、染色体动力学、真核细胞生物学等的影响。最重要的是,我们希望本书所讨论的这些问题能够激发读者进行讨论或产生新的想法,提出新的假设或者进行新的实验,从而对质粒生物学乃至分子生物学有更新的理解。我们虽曾屡次产生过撰写本书的想法,但本书的付诸实施和完成有赖ASM出版社Gregory Payne先生的倡议和鼓励,我们对他的帮助和指导不胜感激。我们还要感谢Stuart Austin在启动本书出版工作中所提供的帮助。我们也非常感谢本书所有编写者所做的高质量工作以及各章校阅人员作出的贡献。我们也要感谢我们过去的导师和同事Peter Borgia、Ross Inman、Authur Kornberg、Sidney Kushner、Jack Parker、Tom Silhavy和Michael Yarmolinsky,感谢他们对微生物学所表现出的热情和对微生物在生物学研究中重要性的认识。  

Barbara E.FunnellGregory J.Phillips(陈惠鹏张惟材译) 

[目录]
第1章质粒简介:质粒研究史1  
11遗传学时代2  
12环状质粒DNA4  
13质粒作为分子克隆载体:大胆的创新5  
14质粒的自我复制过程7  
15质粒的迁移性9  
16质粒的稳定性12  
17结论14  
参考文献15  

第2章参与含有重复子质粒复制的元件21  
21复制起始的基本元件22  
22rep基因的表达和Rep蛋白的结构24  
23调控模型26  
24非重复子的Rep结合、辅助因子和它们的作用30  
25ori激活的分子机制31  
26质粒在细胞内的定位34  
27结论:质粒DNA和在广范围环境中的复制34  
参考文献35  
第3章反义RNA对质粒复制的调控作用43  
31反义RNA介导的转录衰减:inc18和pT181家族44  
32翻译水平的抑制49  
33抑制引物的形成:ColE1复制子52  
34抑制假结的形成:如IncIα/IncB54  
参考文献56  
第4章滚环复制60  
41滚环复制质粒的结构60  
42前导链复制的起始与终止61  
43质粒sso在后随链复制中的作用66  
44宿主蛋白在质粒滚环复制中的作用71  
45展望72  
参考文献72  

第5章细菌质粒的分配系统77  
51普通的分配系统77  
52质粒的细胞内定位78  
53质粒分配系统的类型79  
54P1和F质粒84  
55RK2质粒91  
56pTAR和TP228质粒92  
57RepABC系统93  
58R1质粒94  
59其他分配系统95  
510pSC10195  
511具有多种分配系统的质粒96  
512高拷贝数质粒96  
513模型和问题96  
参考文献97  
第6章遗传偏嗜性:基因在基因组中的共生原则102  
61遗传偏嗜性的发现103  
62遗传偏嗜性的类型105  
63基因组学和遗传偏嗜性系统的发展109  
64细胞杀死的机理116  
65基因表达的调节120  
66偏嗜性系统之间的相互作用124  
67为什么会存在偏嗜性基因?128  
68基因组与偏嗜性基因协同进化131  
69其他遗传过程的推测132  
610应用135  
611结论137  
参考文献137  
第7章DNA位点特异性分离系统145  
71一切发生错误之时:DNA多聚体的形成和发生率146  
72DNA位点特异性重组:染色体和质粒的分离148  
73丝氨酸重组酶家族的位点特异性分离系统149  
74酪氨酸重组酶家族的质粒和染色体分离系统154  
75重组机制详述159  
76结论170  
参考文献171  
第8章质粒DNA的拓扑行为179  
81环状DNA拓扑学179  
82DNA拓扑酶184  
83动力拓扑学平衡185  
84超螺旋敏感DNA结构186  
85体内限制与非限制的质粒拓扑学187  
86大肠杆菌内由蛋白质限制的拓扑学188  
87体内限制性和非限制性超螺旋变化191  
88DNA复制:可逆的复制叉、前环连体和结193  
89结论196  
参考文献196  
第9章革兰阴性菌接合转移201  
91质粒分类202  
92染色体诱动203  
93革兰阴性菌中的接合转移概述204  
94接合转移生理学205  
95菌毛的结构和装配206  
96菌毛收缩和噬菌体感染208  
97接合转移孔的结构209  
98交配配对的形成212  
99进入排斥或表面排斥213  
910DNA的加工和转运213  
911启动转移的“信号”的本质216  
912可诱动质粒216  
913受体细胞中质粒的建立217  
914转移基因表达的调控218  
915F转移基因的调控218  
916RP4转移区的调节219  
917结论220  
参考文献221  
第10章革兰阳性菌的接合227  
101不同种属的质粒系统228  
102接合型转座子242  
103转移起点和松弛酶245  
104结论247  
参考文献247  

第11章泛宿主性质粒在革兰阴性杆菌中的复制策略261  
111复制体的组装262  
112Rep蛋白和复制起始序列的通用性特征:IncP质粒家族263  
113宿主范围受控于装配复制体所需要的编码蛋白:IncQ家族267  
114自然发生的多复制子质粒268  
115泛宿主性质粒的其他特征269  
116通过对窄宿主性复制子的研究分析宿主范围决定子269  
117结论270  
参考文献271  
第12章根瘤菌科细菌的共生质粒274  
121引言:结瘤和固氮274  
122质粒和岛:根瘤菌科细菌共生基因的定位276  
123共生质粒基因组成概况277  
124pSym质粒的复制和分配特征281  
125接合转移283  
126pSym的动力学及其进化287  
127展望289  
128补遗290  
参考文献291  
第13章细菌中的线性质粒:相同的起源,不同的命运296  
131线性质粒和染色体的系统发生学分布296  
132线性质粒的组成298  
133细菌中线性质粒的结构298  
134线性质粒的复制301  
135线性质粒的分离系统304  
136展望304  
参考文献304  
第14章酿酒酵母的2μm质粒307  
141自身携带和作为一般实验工具的酵母质粒308  
142酵母质粒的高拷贝数和稳定遗传308  
143质粒分配系统的分析309  
1442μm质粒分离模型313  
1452μm质粒的拷贝数控制315  
146Flp重组机制316  
147Flp的应用319  
1482μm质粒分子自私性的环状设计:进化考虑320  
1492μm质粒与衰老、寿命和程序化细胞死亡的关系321  
1410展望与前景321  
1411结论323  
1412补遗324  
参考文献325  
第15章哺乳动物细胞内的病毒性质粒329  
151EB病毒329  
152乳头瘤病毒337  
153结论340  
参考文献340  
第16章降解质粒345  
161TOL质粒349  
162编码途径与TOL相关的质粒352  
163携带氯苯邻二酚ortho裂解途径基因的质粒355  
164洋葱伯克霍尔德菌 AC1100的复制子359  
165携带外周途径基因质粒的特征361  
166降解质粒的进化363  
167结论369  
参考文献369  
第17章古细菌质粒381  
171质粒分类382  
172复制、分配和维持的机理386  
173细胞内扩散机理388  
174染色体整合392  
175基于质粒的载体系统395  
176结论395  
参考文献396  

第18章毒力质粒的基因组规模分析:质粒上的毒力基因对于肠细菌致病性的作用400  
181肠杆菌质粒的一般特性403  
182大质粒的序列分析407  
183质粒的维持功能:复制、分配和分离后杀死408  
184质粒编码的毒力基因410  
参考文献414  
第19章芽孢形成菌的毒性质粒419  
191破伤风梭状芽孢杆菌和肉毒梭状芽孢杆菌的神经毒素质粒419  
192产气荚膜梭状芽孢杆菌的毒素质粒421  
193炭疽杆菌的毒素和荚膜质粒423  
194苏云金芽孢杆菌的杀虫毒素质粒425  
195结论426  
参考文献426  
第20章耶尔森菌的毒力质粒:特性和比较430  
201耶尔森菌的质粒和毒力431  
202LCR质粒432  
203鼠毒素质粒438  
204鼠疫菌素质粒442  
205抗性转移因子442  
206pYC隐蔽型质粒443  
207结论444  
参考文献444  
第21章不产芽孢的革兰阳性病原菌的毒力质粒447  
211金黄色葡萄球菌的毒力质粒448  
212粪肠球菌的毒力质粒450  
213红球菌的毒力质粒456  
214结论457  
参考文献457  
第22章根瘤农杆菌Ti质粒463  
221Ti质粒的序列463  
222转移DNA464  
223vir区域466  
224VirAVirG双组分调控系统466  
225界间转位过程中效应分子的加工467  
226VirB/VirD4 Ⅳ型分泌系统469  
227底物转移和菌毛合成的中心结构473  
228Ti质粒的接合475  
229冠瘿碱的摄取及代谢476  
2210自诱导/细胞密度感应476  
2211Ti质粒的复制477  
2212Ti质粒及染色体功能的协同进化478  
2213展望478  
参考文献479  
第23章抗药性质粒483  
231质粒分类483  
232质粒介导的抗药性机制488  
233细菌病原体中抗生素抗性基因的进化和扩散492  
234抗性质粒的全序列测定494  
参考文献497  
第24章pJM1和pColVK30:含细菌毒力必需的铁摄取基因的质粒504  
241鳗弧菌的pJM1系统505  
242质粒介导的离子摄取系统的表达调控508  
243pColVK30质粒介导的铁摄取系统511  
244气杆菌素系统的分子流行病学514  
245结论516  
参考文献517  

第25章细菌质粒的进化和群体遗传学521  
251作为完全自私元件的质粒523  
252质粒给予宿主菌的好处525  
253复杂和变化的群体有利于质粒的存在528  
254产生多样性的重组过程530  
255细胞内竞争534  
256结论537  
参考文献538  
第26章细菌的第二染色体和巨质粒542  
261原核生物染色体543  
262第二染色体、巨质粒和大质粒544  
263巨质粒和大质粒546  
264第二染色体和巨质粒的本质547  
265代表性种属的第二复制子547  
266结论552  
参考文献553  

第27章基因克隆与表达的质粒载体558  
271基因克隆载体558  
272表达载体系统561  
273基因表达载体元件567  
274由质粒递送的基因的表达572  
275结论与发展趋势573  
参考文献573  
第28章质粒是研究细菌基因功能的遗传学工具581  
281质粒是构建突变体的工具581  
282质粒用于更多的反选择策略586  
283质粒系统用于捕捉启动子586  
284质粒是一种递送工具587  
285质粒用于各种遗传学操作588  
286质粒是基因组和亚基因组工程的工具588  
287质粒用于体内克隆和修饰系统591  
288质粒载体用于染色体整合592  
289质粒重排用于基因功能分析593  
2810质粒在无抗性压力下的维持594  
2811质粒是真核生物和病毒研究的工具594  
2812结论595  
参考文献595  
第29章质粒可以作为抑制工具602  
291主动抑制:基本原理及报告元件603  
292针对生物降解细菌的抑制策略608  
293增强抑制的策略611  
294主动抑制系统可作为应用和基础研究的工具612  
295结论与展望613  
参考文献614  
索引616  考研共济 (责任编辑:大汉昆仑王)
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